Laboratoř pro výzkum extracelulárních vezikul
Laboratoř pro výzkum extracelulárních vezikul je moderní pracoviště zabývající se separacemi a identifikací proteinů v tkáních, buňkách a tělních tekutinách. Hlavním zájmem naší laboratoře je studium a hledání biomarkerů a patofyziologie různých onemocnění. V současnosti je laboratoř zejména zaměřena na studium nových diagnostických a prediktivních biomarkerů v močových exosomech u pacientů s autoimunitním onemocněním ledvin (lupus nefritis a ANCA-asociované vaskulitidy) a IgA nefropatie.
Exosomy jsou membránové nanovezikuly endocytárního původu obsahující
cytoplasmu (40-100 nm). Močové exosomy obsahují proteiny a nukleové kyseliny,
včetně mikroRNA, které specificky odrážejí fyziologické a patologické stavy
buněk z odlišných částí ledvin. Jejich proteomická analýza a analýza exprese
mikroRNA může proto vést k nalezení specifických biomarkerů, které se dále
stanovují u pacientů v různých stádiích onemocnění a v korelaci dalšími
parametry onemocnění, s funkcí a biopsií ledvin, s odpovědí na léčbu a s
dlouhodobým vývojem choroby.
Cílem naší skupiny je nalézt nové biomarkery v moči pacientů s různým
onemocněním ledvin a použít je pro jejich konkrétní, neinvazivní klinické
testování a monitorování.
Současně ve spolupráci s Anatomickým ústavem provádíme výzkum exosomů v oblasti kožních nádorů. Výsledky předchozích výzkumů jasně ukázaly významnou roli nádorového
mikroprostředí na růst a šíření zhoubných nádorů, kde významnou roli hrají
nádorově asociované fibroblasty. Exosomy jsou známé jako důležitý faktor
nádorového prostředí, ale data jejich významu při komunikaci nádorově
asociovaných fibroblastů s nádorovými buňkami jsou omezená. Proto je tento výzkum v centru zájmu aktuálního projektu.
V naší laboratoři využíváme k výzkumu řadu separačních a detekčních technik, jako je:
kapalinová chromatografie, hmotnostní spektrometre, 1D a 2D gelová
elektroforéza, ELISA, western blot, ultracentrifugace, analýza trajektorie nanočástic,
FACS, PCR, elektronová mikroskopie a jiné.
Členové skupiny:
RNDr. Petr Přikryl, Ph.D. (tel. 224 965 926, email: petr.prikryl@lf1.cuni.cz)
prof. MUDr. Martin Vokurka, CSc.
RNDr. Jana Frýdlová, Ph.D.
Ing. Jan Krijt, Ph.D. (spolupráce)
Granty:
GAČR, 19-05048S - Význam exosomů v přenosu informací mezi nádorově asociovanými fibroblasty a nádorovými buňkami s důrazem na maligní melanom (2019-2021, M. Kolář)
AZV, NV15-31662A - Lidské močové exosomy - zdroj nových biomarkerů pro diagnostiku a sledování nemocí ledvin (2015-2019, M. Vokurka)
Spolupráce:
Anatomický ústav, 1. LF UK Praha
Klinika nefrologie, 1. LF UK a VFN Praha
Ústav lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky, 1. LF UK a VFN Praha
Laboratoř chemické robotiky, Ústav chemického inženýrství, VŠCHT Praha
Ústav biologie a lékařské genetiky, 1. LF UK a VFN Praha
Radiodiagnostická klinika, 1. LF UK a VFN Praha
Hlavní publikace:
- Prikryl P, Satrapova V, Frydlova J, Hruskova Z, Zima T, Tesar V, Vokurka M. Mass spectrometry-based proteomic exploration of the small urinary extracellular vesicles in ANCA-associated vasculitis in comparison with total urine. J Proteomics. 2021 Feb 20;233:104067.
- Korabecna M, Zinkova A, Brynychova I, Chylikova B, Prikryl P, Sedova L, Neuzil P, Seda O. Cell-free DNA in plasma as an essential immune system regulator. Sci Rep. 2020 Oct 15;10(1):17478.
- Přikryl P, Hrušková Z, Konopásek P, Hladinová Z, Tesař V, Vokurka M. Serum hepcidin is increased in ANCA-associated vasculitis and correlates with activity markers. Physiol Res. 2018 Dec 18;67(6):945-954. doi: 10.33549/physiolres.933765.
- Prikryl P, Vojtova L, Maixnerova D, Vokurka M, Neprasova M, Zima T, Tesar V. Proteomic approach for identification of IgA nephropathy-related biomarkers in urine. Physiol Res. 2017 Sep 22;66(4):621-632. doi: 10.33549/physiolres.933380.
- Vojtová L, Zima T, Tesař V, Michalová J, Přikryl P, Dostálová G, Linhart A. Study of urinary proteomes in Anderson-Fabry disease. Ren Fail. 2010;32(10):1202-9.