Publikace 2012
Seznam publikací za rok 2012:
a) v impaktovaných časopisech:
N Curik, P Burda, K Vargova, V Pospisil, M Belickova, P Vlckova, F Savvulidi, E Necas, H Hajkova, C Haskovec, J Cermak, M Krivjanska, M Trneny, P Laslo, A Jonasova and T Stopka. 5-Azacitidine in aggressive myelodysplastic syndromes regulates chromatin structure at PU.1 gene and cell differentiation capacity. Leukemia, 2012 Aug;26(8):1804-11. IF: 8,99
REJMAN, Dominik, PANOVA, N., KLENER, Pavel, MASWABI, Bokang, POHL, R., ROSENBERG, Ivan. N-phosphonocarbonylparrolidine derivatives of guanine: a new class of bi-substrate inhibitors of human purine nucleoside phosphorylase. J Med Chem, 2012; 55(4):1612-21. IF=5,207
Krijt J, Frýdlová J, Kukačková L, Fujikura Y, Přikryl P, Vokurka M, Nečas E. Effect of iron overload and iron deficiency on liver hemojuvelin protein. PLoS One. 2012;7(5):e37391. IF=4.092
Hlobeňová T, Sefc L, Chang KT, Savvulidi F, Michalová J, Nečas E. B-lymphopoiesis gains sensitivity to subsequent inhibition by estrogens during final phase of fetal development. Dev Comp Immunol. 2012 Feb;36(2):385-9. IF = 3,268
Hofer M., Pospíšil M., Hoferová Z., Komůrková D., Páral P., Savvulidi F., and Šefc L. The pharmacological activation of adenosine A1 and A3 receptors does not modulate the long- or short-term repopulating ability of hematopoietic stem and multipotent progenitor cells in mice. Purinergic Signalling, in press (DOI: 10.1007/s11302-012-9340-5) IF = 3,164
Sillerova T, Zivny J, Vyoral D, Petrak J. Nutritional hepatic iron overload is not prevented by parenteral hepcidin substitution therapy in mice. Br J Nutr. 2012 108, 1723–1725 IF=3,01
Rajčanová M, Tichá M, Kučerová Z.Application of heptapeptides containing D-amino acid residues immobilized to magnetic particles and Sepharose for the study of binding properties of gastric aspartic proteases.J Sep Sci. 2012 Aug;35(15):1899-905. IF 2.74
SANDA P., MARSALEK, P., Stochastic interpolation model of the medial superior olive neural circuit, Brain Res, 1434, 257-265, 2012. IF (2010) = 2.623.
MOLINSKY, Jan, KLANOVA, Magdalena, KOC, Michal, BERANOVA, Lenka, ANDERA, Ladivslav, LUDVIKOVA, Zdenka, BÖHMOVA, Martina, GASOVA, Zdenka, STRNAD, Miroslav, IVANEK, Robin, TRNENY, Marek, NECAS, Emanuel, ZIVNY, Jan, KLENER, Pavel. Roscovitine sensitizes leukemia and lymphoma cells to TRAIL-induced apoptosis. Leuk Lymphoma, 2012; IF=2,580
DREYLING, Martin, KLUIN-NELEMANS, Hanneke C., BEÁ, Silvía., KLAPPER, Wolfram, VOGT, Niclas, DELAFAU-LARUE, Marie-Helene, HUTTER, Grit, CHEAH, Chan, CHIAPPELLA, Annalisa, CORTELAZZO, Sergio, POTT, Christiane, HESS, Georg, VISCO, Carlo, VITOLO, Umberto, KLENER, Pavel, AURER, Igor, UNTERHALT, Michael, RIBRAG, Vincent, HOSTER, Eva, HERMINE, Olivier; for the European MCL Network. Update on the molecular pathogenesis and clinical treatment of mantle cell lymphoma - report of the 11(th) annual conference of the EUROPEAN MANTLE CELL LYMPHOMA NETWORK. Leuk Lymphoma, 2012 Sep 28; IF=2,580
Lorkova L, Pospisilova J, Lacheta J, Leahomschi S, Zivny J, Cibula D, Zivny J, Petrak J. Decreased concentrations of retinol-binding protein 4 in sera of epithelial ovarian cancer patients: a potential biomarker identified by proteomics. Oncol Rep. 2012 Feb;27(2):318-24., IF =1.83
Prikryl P, Lenfeld J, Horak D, Ticha M, Kucerova Z: Magnetic Bead Cellulose as a Suitable Support for Immobilization of α-Chymotrypsin.Appl Biochem Biotechnol. 2012 Sep;168(2):295-305.IF=1.64
KLENER, Pavel jr., KLENER, Pavel sr. Molecularly-Targeted and Biological Anti-Cancer Therapy. Folia Biol-Prague, 2012; 58(1):1-6, IF=1,151
STROFFEK J., MARSALEK P., Short term potentiation effect on pattern recall in sparsely coded neural network, Neurocomputing, 77, 108-113, 2012. IF (2010) = 1.429
KURISCAK E., MARSALEK P., STROFFEK J., WüNSCH Z., The effect of neural noise on spike time precision in a detailed CA3 neuron model, Comput. Math. Meth. in Medicine, , 2012. IF (2010) = 0.814
b) další odborné publikace
Kofránek, Jiří, Pecinovský, Rudolf, Novák, Petr: Kopenograms – graphical language for structured algorithms. In Proceedings of the 2012 International conference on foundation of computer science, (Hamid R. Arabnia, Geroge A. Gravvanis, Ashu M. G. Solo Eds), CSREA Press, Las Vegas, Nevada, USA, 2012, str. 90-96, ISBN 1-60132-211-9.
Pecinovský Rudolf, Kofránek Jiří: How to improve understanding of OOP constructs. Preprints of the 2nd Computer Science Education Research Conference, September 9–12, 2012. Wrocław, Poland, pp. 19-24
Cagaš, Pavel, Cagaš, Roman, Kofránek, Jiří: CCD kamery pro snímání extrémně slabých světelných zdrojů. In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 18-36, ISSN 1803-8115.
Ježek, Filip, Kroček, Tomáš, Mateják, Marek, Kofránek, Jiří: Zkušenosti z inovace výuky modelování a simulace na FEL ČVUT. In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 139-146, ISSN 1803-8115.
Cagaš, Roman, Cagaš, Pavel, Kofránek, Jiří: Programový systém control web a jeho možnosti interakce s reálným prostředím. In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 37-47, ISSN 1803-8115.
Tribula, Martin, Vavrek, Martin, Otčenášek, Michal: Tvorba 3d výukových aplikací pomocí technologie Microsoft Silverlight.In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 283-287, ISSN 1803-8115.
Kofránek, Jiří: Integrované modely fyziologických systémů – historie, současnost, perspektivy. In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 73-105, ISSN 1803-8115.
Mateják, Marek, Nedvědová, Barbora, Doležalová, Anna, Kofránek, Jiří, Kulhánek, Tomáš: Model ECMO oxygenátoru. In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 205-214, ISSN 1803-8115.
Šilar, Jan, Vavrek, Martin, Kulhánek, Tomáš, Privitzer, Pavol, Kofránek, Jiří, Kroček, Tomáš, Tribula, Martin: Výpočty na grafických procesorech, řešení parciálních diferenciálních rovnic. In MEDSOFT 2012, (Milena Ziethamlová Ed.) Praha: Agentura Action M, Praha, str. 252-259, ISSN 1803-8115.
Kofránek, Jiří: Jak propojit informační systémy veřejné správy a nevytvořit "Velkého bratra". Informační bulletin, Úřad pro ochranu osobních údajů. 1, 2012, str. 25-30.
D. Vyoral a J. Petrák Metabolizmus železa a jeho regulace Vnitřní Lékařství 2012, Aug;58 Suppl 2
Obdržálek, Jan, Kofránek, Jiří, Svítek, Miroslav: Tablet based interactive GPS textbook – a new kind of an educational means. In The World Conference on Physics Education, 2012. Book of Abstracts. (M. Fatih Taşar Ed.), Gazi Üniversitesi, Ankara, Turkey, 2012, str. 273.
Honěk J, Januška J, Novotný Š, Šefc L, Fiedler J, Šrámek M, Hoňková-Radilová K, Parobková M, Veselka J, Honěk T. Detekce dusíkových bublin po simulovaném ponoru potápěčů s foramen ovale patens. Kdy doporučit katetrizační uzávěr? Intervenční a akutní kardiologie. 2012; 11(3-4), 108-111.
Honěk J, Honěk T, Januška J, Sebesta P, Novotný S, Sefc L, Fiedler J, Srámek M, Horváth M, Parobková M. Perzistence foramen ovale patens a riziko paradoxní embolizace žilních bublin u potápěčů – cave pro sklerotizaci varixů pěnovou metodou. Rozhl Chir. 2012 Jul;91(7):378-80.
Nikola Čuřík, Pavel Burda, Karin Vargová, Vít Pospíšil, Mária Krivjanská,
Marek Trněný, Anna Jonášová a Tomáš Stopka. Nové technologie v medicíně pomáhají pacientům s MDS. Medical Tribune 2012, Ročník VIII, číslo 6, 2. dubna 2012.
Stopka Tomáš, Zavadil Jiří, Čuřík Nikola. Mezinárodní symposium o genové regulaci v Praze. Medical Tribune 2012, Ročník VIII, číslo 13, 11. června 2012. IF: 0
Diplomová práce: Jakub Benýšek Příprava slepičích protilátek proti fosfoserinovým zbytkům fosfoproteinů Katedra biochemie Přírodovědecká fakulta Univerzita Karlova v Praze, obhájeno červen 2012
Bakalářská práce : Denisa Plecitá Charakterizace enzymového reaktoru s imobilizovanou alkalickou fosfatázou Obor klinická a toxikologická analyza Přírodovědecká fakulta Univerzita Karlova v Praze, obhájeno září 2012
Šefc L. : Lekce EUNI: Potápění s cukrovkou. http://dia.euni.cz/clanek2.php?clanek=733&kat=93 ISSN 1803-6619, 2012.
c) v tisku a v přípravě
Forgáčová K, Nečas E. Availability of hematopoietic niches for transplanted stem cells.
Folia Biologica (Praha), v tisku, IF = 1,151
MOLINSKY, Jan, KLANOVA, Magdalena, MASWABI, Bokang, SOUKUP, Tomas, TRNENY, Marek, NECAS, Emanuel, ZIVNY, Jan, KLENER, Pavel. In Vivo Growth of Mantle Cell Lymphoma Xenografts in Immunodeficient Mice Is Positively Regulated by VEGF and Associated with Significant Upregulation of CD31/PECAM-1. Folia Biol-Prague, 2012; in press. IF=1,151
Petra Vlckova, Libor Stanek, Pavel Burda, Karin Vargova, Filipp Savvulidi, Martina Kapalova, Ulrich Steidl, and Tomas Stopka. Aggressive acute myeloid leukaemia in PU.1/ p53 double mutant mice. (resubmission to Cancer Research (IF:7,8) in November 2012)
Do tisku je připraveno: Prikryl P, Ticha M, Kucerova Z Immobilized endoproteinase GluC to cellulose magnetic beads as a tool in proteomic analysis Journal of Chemical Technology and Biotechnology
Do tisku připraveno Helena Hlídková1, Daniel Horák1*, Vladimír Proks1, Zdenka Kučerová2, Michal Pekárek1, Jan Kučka1, Miroslav Šlouf1 PEG-modified poly(glycidyl methacrylate) and poly(2-hydroxyethyl methacrylate) microspheres to reduce nonspecific protein adsorption. Rapid Macromol.Commun.