Publications 2014
ALVAREZ-SAAVEDRA,
Matias - DE REPENTIGNY, Yves - LAGALI, Pamela S. - RAM, Edupuganti V. S. Raghu
- YAN, Keqin - HASHEM, Emile - IVANOCHKO, Danton - HUH, Michael S. - YANG, Doo
- MEARS, Alan J. - TODD, Matthew A. M. - CORCORAN, Chelsea P. - BASSETT, Erin
A. - TOKAREW, Nicholas J. A. - KOKAVEC, Juraj - MAJUMDER, Romit - IOSHIKHES,
Ilya - WALLACE, Valerie A. - KOTHARY, Rashmi - MESHORER, Eran - STOPKA, Tomáš -
SKOULTCHI, Arthur I. - PICKETTS, David J.. Snf2h-mediated chromatin
organization and histone H1 dynamics govern cerebellar morphogenesis and neural
maturation. Nature Communications, 2014, 5(JUN 2014),
nestránkováno. ISSN 2041-1723.
IF = 10.742 (2013)
BAŠOVÁ, Petra - POSPÍŠIL, Vít - SAVVULIDI, Filipp Geirgievich - BURDA, Pavel -
VARGOVÁ, Karina - STANĚK, Libor - DLUHOŠOVÁ, Martina - KUŽMOVÁ, Erika -
JONÁŠOVÁ, Anna - STEIDL, U. - LASLO, P. - STOPKA, Tomáš. Aggressive acute
myeloid leukemia in PU.1/p53 double-mutant mice. Oncogene, 2014, 33(39),
4735-4745. ISSN 0950-9232.
IF = 8.559 (2013)
BAŠOVÁ, Petra. Studium mechanismů agresivity akutní myeloidní leukemie v
myším modelu nesoucím mutace genů Spi1 (PU.1) a Trp53. Praha, 2014. 190 s.
dizertační práce. Univerzita Karlova v Praze.
ČUŘÍK, Nikola - DLUHOŠOVÁ, Martina - JONÁŠOVÁ, Anna - STOPKA, Tomáš. Azacytidin
v nádorových buňkách ovlivňuje geny s protinádorovým účinkem. Medical
Tribune, 2014, 10(5), C3-C3. ISSN 1214-8911.
DLUHOŠOVÁ, Martina - ČUŘÍK, Nikola - JONÁŠOVÁ, Anna - STOPKA, Tomáš.
Patofyziologické poznámky k diferenciační terapii 5-azacytidinem u MDS. Myelodysplastic
Syndrome News, 2014, 2(1), 10-18. ISSN 2336-1093.
DLUHOŠOVÁ, Martina - ČUŘÍK, Nikola - VARGOVÁ, Jarmila - JONÁŠOVÁ, Anna -
ZIKMUND, Tomáš - STOPKA, Tomáš. Epigenetic Control of SPI1 Gene by CTCF and
ISWI ATPase SMARCA5. PLoS ONE, 2014, 9(2), nestránkováno. ISSN
1932-6203.
IF = 3.534 (2013)
DRÁB, Tomáš - KRAČMEROVÁ, Jana - HANZLÍKOVÁ, Eva - ČERNÁ, Tereza - HEXNEROVÁ,
Rozálie - POHLOVÁ, Alžběta - TICHÁ, Marie - PŘIKRYL, Petr - LIBERDA, Jiří. The
antimicrobial action of histones in the reproductive tract of cow. Biochemical
and Biophysical Research Communications, 2014, 443(3), 987-990. ISSN
0006-291X.
IF = 2.281 (2013)
DRÁPALOVÁ, Jana - KOPECKÝ, Petr - BÁRTLOVÁ, Markéta - LACINOVÁ, Zdeňka - NOVAK,
Daniel - MARUNA, Pavel - LIPŠ, Michal - MRÁZ, Miloš - LINDNER, Jaroslav -
HALUZÍK, Martin. The influence of deep hypothermia on inflammatory status,
tissue hypoxia and endocrine function of adipose tissue during cardiac surgery.
Cryobiology, 2014, 68(2), 269-275. ISSN 0011-2240.
IF = 1.643
HONĚK, Jakub - ŠRÁMEK, Martin - ŠEFC, Luděk - JANUSKA, Jaroslav - FIEDLER, Jiří
- HORVÁTH, Martin - TOMEK, Aleš - NOVOTNY, Stepan - HONEK, Tomas - VESELKA,
Josef. Effect of Catheter-Based Patent Foramen Ovale Closure on the Occurrence
of Arterial Bubbles in Scuba Divers. JACC: Cardiovascular Interventions,
2014, 7(4), 403-408. ISSN 1936-8798.
IF = 7.440 (2013)
HONĚK, Jakub - ŠRÁMEK, Martin - ŠEFC, Luděk - JANUSKA, Jaroslav - FIEDLER, Jiří
- HORVÁTH, Martin - TOMEK, Aleš - NOVOTNY, Stepan - HONEK, Tomas - VESELKA,
Josef. Effect of conservative dive profiles on the occurrence of venous and
arterial bubbles in divers with a patent foramen ovale: A pilot study. International
Journal of Cardiology, 2014, 176(3), 1001-1002. ISSN 0167-5273.
IF = 6.175 (2013)
HORAK, Daniel - HLIDKOVA, Helena - HIRAOUI, Mohamed - TAVERNA, Myriam - PROKS,
Vladimir - CHANOVA, Eliska Mazl - SMADJA, Claire - KUČEROVÁ, Zdenka.
Monodisperse Carboxyl-Functionalized Poly(Ethylene Glycol)-Coated Magnetic
Poly(Glycidyl Methacrylate) Microspheres: Application to the Immunocapture of
beta-Amyloid Peptides. Macromolecular Bioscience, 2014, 14(11),
1590-1599. ISSN 1616-5187.
IF = 3.650 (2013)
KLÁNOVÁ, Magdalena - SOUKUP, Tomáš - JAKŠA, Radek - MOLINSKÝ, Jan - LATEČKOVÁ,
Lucie - MASWABI, Bokang Calvin - PRŮKOVÁ, Dana - BŘEZINOVA, Jana - MICHALOVA,
Kyra - VOČKOVÁ, Petra - HERNANDEZ-ILIZALITURRI, Francisco - KULVAIT, Vojtěch -
ŽIVNÝ, Jan - VOKURKA, Martin - NEČAS, Emanuel - TRNĚNÝ, Marek - KLENER, Pavel.
Mouse models of mantle cell lymphoma, complex changes in gene expression and
phenotype of engrafted MCL cells: implications for preclinical research. Laboratory
Investigation, 2014, 94(7), 806-817. ISSN 0023-6837.
IF = 3.828 (2013)
KLÁNOVÁ, Magdalena - LORKOVÁ, Lucie - VÍT, Ondřej - MASWABI, Bokang Calvin -
MOLINSKÝ, Jan - POSPÍŠILOVÁ, Jana - VOČKOVÁ, Petra - MAVIS, Cory - LATEČKOVÁ,
Lucie - KULVAIT, Vojtěch - VEJMELKOVÁ, Dana - JAKŠA, Radek - HERNANDEZ,
Francisco - TRNĚNÝ, Marek - VOKURKA, Martin - PETRÁK, Jiří - KLENER, Pavel.
Downregulation of deoxycytidine kinase in cytarabine-resistant mantle cell
lymphoma cells confers cross-resistance to nucleoside analogs gemcitabine,
fludarabine and cladribine, but not to other classes of anti-lymphoma agents. Molecular
Cancer, 2014, 13(neuveden), nestránkováno. ISSN 1476-4598.
IF = 5.397 (2013)
KRATOCHVILOVA, Irena - SEBERA, Jakub - ASHCHEULOV, Petr - GOLAN, Martin -
LEDVINA, Miroslav - MICOVA, Julia - MRAVEC, Filip - KOVALENKO, Alexander -
ZVEREV, Dmitry - YAVKIN, Boris - ORLINSKII, Sergei - ZALIS, Stanislav -
FISEROVA, Anna - RICHTER, Jan - ŠEFC, Luděk - TURANEK, Jaroslav. Magnetical and
Optical Properties of Nanodiamonds Can Be Tuned by Particles Surface Chemistry:
Theoretical and Experimental Study. Journal of Physical Chemistry C,
2014, 118(43), 25245-25252. ISSN 1932-7447.
IF = 4.835 (2013)
KULHÁNEK, Tomáš - TRIBULA, Martin - KOFRÁNEK, Jiří - MATEJÁK, Marek. Simple
models of the cardiovascular system for educational and research purposes. Mefanet
Journal, 2014, 2(2), 56-63. ISSN 1805-9163.
KULHÁNEK, Tomáš - KOFRÁNEK, Jiří - MATEJÁK, Marek. Modeling of short-term
mechanism of arterial pressure control in the cardiovascular system:
Object-oriented and acausal approach. Computers in Biology and Medicine,
2014, 54(NOV 2014), 137-144. ISSN 0010-4825.
IF = 1.475 (2013)
KULHÁNEK, Tomáš - MATEJÁK, Marek - ŠILAR, Jan - KOFRÁNEK, Jiří. Parameter
estimation of complex mathematical models of human physiology using remote
simulation distributed in scientific cloud. In: In Biomedical and Health
Informatics. Valencia: IEEE, 2014. s. 712-715. ISBN 978-1-4799-2132-4.
LASLO, Peter - STOPKA, Tomáš. Transcriptional and epigenetic regulation in the
development of myeloid cells: normal and diseased myelopoiesis.. Epigenetics
and Human Health. 1 vyd. Heidelberg: Springer-Verlag Berlin Heidelberg,
2014, s. 233-245. ISBN 978-3-642-45197-3.
LORKOVÁ, Lucie. Proteomické přístupy ke studiu nádorových onemocnění.
Praha, 2014. 105 s. dizertační práce. Univerzita Karlova v Praze.
MATEJÁK, Marek. Physiology in Modelica. Mafanet Journal, 2014, 2(1),
10-14. ISSN 1805-9163.
MATEJÁK, Marek - KULHÁNEK, Tomáš - ŠILAR, Jan - PRIVITZER, Pavol - JEŽEK, Filip - KOFRÁNEK, Jiří. PHYSIOLIBRARY . 2014, Software.
MATEJÁK, Marek - KOFRÁNEK, Jiří. PHYSIOMODEL http://www.physiomodel.org/. 2014, Software.
MIARKOVÁ, Eva. Pohled chemika na RVP G a na učebnici chemie pro gymnázia.. Biologie
- Chemie - Zeměpis, 2014, 23(3), 131-135. ISSN 1210-3349.
NOVOTNÝ, Štěpán - HONĚK, Jakub - JANUŠKA, J - ŠEFC, Luděk - HORVÁTH, Martin -
FIEDLER, Jiří - ŠRÁMEK, Martin - VESELKA, Josef - HONĚK, Tomáš - TATÁR, M.
Foramen ovale patens: katetrizační uzávěr nebo konzervativní profil ponoru jako
prevence dekompresní choroby potápěčů?. Cardiology Letters, 2014, 23(3),
223-227. ISSN 1338-3655.
POSPÍŠILOVÁ, Jana. Proteomika jako nástroj studia molekulárních mechanizmu
závažných onemocnení. Praha, 2014. 136 s. dizertační práce. Univerzita
Karlova v Praze.
RAJČANOVÁ, Michaela. Peptidové inhibitory imobilizované na magnetické nosiče
a Sepharosu aplikované na separaci žaludečních aspartátových proteinas.
Praha, 2014. 98 s. dizertační práce. Univerzita Karlova v Praze.
SCHWARZ, Daniel - KOFRÁNEK, Jiří - ŠTOURAČ, Petr - RAUDASCHL, Adrian. Schola
Ludus: Gamification of Medical Education.. Computer applications, systems and
networks for medical education.. 1 vyd. Brno: Masaryk University, Institute of
Biostatistics and Analyses, 2014, s. 45-62. ISBN 978-80-904731-9-5.
SCHWARZ, Daniel - ŠTOURAČ, Petr - KOFRÁNEK, Jiří - TACHECÍ, Ilja - LUDÍKOVÁ, Barbora. Case-based interactive learning in Mefanet.. Computer applications, systems and networks for medical education.. 1 vyd. Brno: Masaryk University, Institute of Biostatistics and Analyses, 2014, s. 111-145. ISBN 978-80-904731-9-5.
SOCHOR,
Marek - BAŠOVÁ, Petra - PEŠTA, Michal - DUSÍLKOVÁ, Nina Borisovna - BARTOS,
Jiri - BURDA, Pavel - POSPÍŠIL, Vít - STOPKA, Tomáš. Oncogenic MicroRNAs:
miR-155, miR-19a, miR-181b, and miR-24 enable monitoring of early breast cancer
in serum. BMC Cancer, 2014, 14(neuveden), nestránkováno. ISSN
1471-2407.
IF = 3.319 (2013)
STOPKA, Tomáš - MACHOVÁ POLÁKOVÁ, Kateřina. GENES, GENETICS & GENOMICS
(G3). Praha, 2014
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 1. LÉKAŘSKÁ FAKULTA, COM-SYS TRADE SPOL. S R.O., CREATIVE CONNECTIONS S.R.O.. Simulátor virtuálního pacienta. Původce: Kofránek, Jiří - Privitzer, Pavol - Tribula, Martin - Šilar, Jan - Kulhánek, Tomáš - Mateják, Marek - Ježek, Filip. Užitný vzor, CZ 27613 U1. 11.12.2014.
IN PRESS
KALINOVÁ,
Markéta - FROŇKOVÁ, Eva - KLENER, Pavel - FORSTEROVÁ, Kristina - LOKVENC, Milan
- MEJSTŘÍKOVÁ, Ester - BELADA, David - MÓCIKOVÁ, Heidi - TRNĚNÝ, Marek - KODET,
Roman - TRKA, Jan. The use of formalin-fixed, paraffin-embedded lymph node
samples for the detection of minimal residual disease in mantle cell lymphoma..
British Journal of Haematology, 2015, ISSN 0007-1048.
IF = 4.959 (2013)
KULHAVÁ, Lucie - PŘIKRYL, Petr - MIARKOVÁ, Eva - HODEK, Petr - TICHÁ, Marie -
KUČEROVÁ, Zdenka. Chicken and rabbit antibodies against porcine pepsinogen A. Prague
medical report, 2015, ISSN 1214-6994.
KURIŠČÁK, Eduard - MARŠÁLEK, Petr - ŠTROFFEK, Július - TÓTH, Peter. Biological
contextofHebblearninginartificial neuralnetworks, a review. Neurocomputing,
2015, ISSN 0925-2312.
IF = 2.005 (2013)
MACHOVÁ POLÁKOVÁ, Kateřina - KULVAIT, Vojtěch - ADÉLA, Benešová - LINHARTOVÁ,
Jana - KLAMOVÁ, Hana - JARUŠKOVÁ, Monika - DE BENEDITTIS, Caterina - HAFERLACH,
Torsten - BACCARANI, Michele - MARTINELLI, Giovanni - STOPKA, Tomáš - ERNST, Thomas
- HOCHHAUS, Andreas - KOHLMANN, Alexander - SOVERINI, Simona. Next-generation
deep sequencing improves detection of BCR-ABL1 kinase domain mutations emerging
under tyrosine kinase inhibitor treatment of chronic myeloid leukemia patients
in chronic phase. Journal of Cancer Research and Clinical Oncology,
2015, ISSN 0171-5216.
IF = 3.009 (2013)
MATEJÁK, Marek - KULHÁNEK, Tomáš - MATOUŠEK, Stanislav. Adair-Based Hemoglobin
Equilibrium with Oxygen, Carbon Dioxide and Hydrogen Ion Activity. Scandinavian
Journal of Clinical and Laboratory Investigation, 2015, ISSN 0036-5513.
IF = 2.009 (2013)
MLEJNSKÝ, František - KLEIN, AA - LINDNER, Jaroslav - MARUNA, Pavel -
KVASNIČKA, Jan - KVASNIČKA, Tomáš - ZIMA, Tomáš - PECHA, O - LIPŠ, Michal -
RULÍŠEK, Jan - POŘÍZKA, Michal - KOPECKÝ, Petr - KUNSTÝŘ, Jan. A randomised
controlled trial of roller versus centrifugal cardiopulmonary bypass pumps in
patients undergoing pulmonary endarterectomy. Perfusion, 2015, ISSN
0267-6591.
IF = 1.083 (2013)