Klinická proteomika

 

    

Scissors cuts paper, paper covers rock, rock crushes lizard, lizard poisons Spock, Spock smashes scissors, scissors decapitates lizard, lizard eats paper, paper disproves Spock, Spock vaporizes rock, and as it always has, rock crushes scissors.

 

VEDOUCÍ LABORATOŘE:	ČLENOVÉ TÝMU:
doc. RNDr. Jiří Petrák, Ph.D.	Mgr. Ondřej Vít
Tel: 224 965 865	Mgr. Eliška Doktorová
jpetr@lf1.cuni.cz	Mgr. Martin Chmel
Research Gate	Bc. Matěj Běhounek
CV	Wolfram Harrach

    

Proteom představuje kompletní sadu bílkovin, které se v daný okamžik nacházejí v organismu, tkání či buňce. Proteomika usiluje o kvantitativní i kvalitativní popis proteomů a jejich fyziologických i patologických změn. Nejmodernější proteomické postupy umožňují detekci a relativní kvantifikaci až 10 000 bílkovin v jediném experimentu a otevírají tak cestu k popisu mnohých fyziologických a patologických procesů na molekulární úrovni. Právě s pomocí proteomických nástrojů – účinných elektroforetických a chromatografických separačních metod kombinovaných s hmotnostní spektrometrií - se naše laboratoř pokouší popisovat molekulární mechanismy závažných onemocnění, vyhledávat klinicky využitelné biomarkery nebo odhalovat procesy zodpovědné za rezistenci nádorových buněk na terapii.

Pro zájemce o podrobnější vhled do proteomiky doporučujeme následující text: Úvod do proteomiky 

   

Laboratoř je vybavena hmotnostním spektrometrem Autoflex typu MALDI TOF-TOF firmy Bruker. Přístroj je využíván především k identifikaci bílkovin po jednorozměrné i dvojrozměrné elektroforéze, ale i k profilování malých bílkovin a peptidů v tělních tekutinách. V kombinaci s nano-HPLC a robotickým sběračem frakcí pro MALDI je hmotnostní spektrometr využíván k tzv. shot-gun proteomickým analýzám komplexních vzorků, nejčastěji s využitím kvantitativního značení iTRAQ nebo SILAC.

 

 

     

Aktuální výzkumné projekty: 

*  Proteomická analýza změn v myokardu při  

    srdečním selhání
*  Proteomická analýza vývoje lékové rezistence u

    nádorů
*  Identifikace biomarkerů závažných onemocnění

*  Vývoj nových metod pro analýzu transmembránových

   bílkovin

 

Kromě řešení svých vlastních výzkumných projektů laboratoř  nabízí tyto služby:

• identifikace bílkovin z gelů a roztoků (MS a MS/MS)
• proteomické analýzy komplexních vzorků
• značení a kvantiativní proteomická analýza typu iTRAQ, SILAC...
• školení a servis v oblasti dvojrozměrné elektroforézy a dalších proteomických technik

 NAŠE LABORATOŘ JE SOUČÁSTÍ CENTRA EXCELENCE  

 

 

 

Ale nejsme závislí jen na práci! 

Navštivte naší stránku 

CAPSAICIN ADDICTION. 

                                                                             

  

 

---